当地的内道佛教未遭受土耳其人（藏语）的迫害。继阿阇莲花生到吐蕃，有关历史，前文已有介绍。称为《王协》、《喇协》、《巴协》的三文书及《补编》等的大部分记载亦如上述。入吐蕃后，对塘拉（藏语）、雅拉希波（藏语虽未入教，但发誓不做损害之事）、十二丹玛、九年神等吐蕃神灵，曾降伏过两次，一次性予以降伏的说法是不成立的。莲花生给桑希建造的红崖真桑神殿举行开光，向吐蕃的国王、属民们传授了灌顶和教授，尤其向国王传授了“观世音五尊”法（藏语），国王进行观修，而成就“幻网”中所说“马头明王五尊”（藏语）。莲花生还降伏了“白哈”（藏语）神，制伏了龙卓斯坚，并说从朗那（藏语）金矿中掘出黄金做为建造桑耶寺之资（共有骡驮十四）。之后，莲花生主持了桑耶净地仪式，建造阿拉雅巴洛神殿时，返回印度。达部分古籍中都一致认为莲花生在吐蕃住了十八个月，伏藏者们说住了五十年以上，但难以置信。莲花生经印度到达卓登（藏语）的止弥只巴（藏语）岛，在玛贝塔（藏语）、埃贝塔（藏语）等地制伏了魔女、罗刹、夜叉、龙等。调伏当地国王的阳神饿鬼名巴达热者，使国王信奉佛教，并从摩揭陀迎请了众多学者，建造名为布达阿拉哈（藏语）的三座神殿等，广弘显密二教。莲花生在该地行利益教法众生的事业达六年，继赴罗刹国。藏区有“顶上珍宝”和“二耳饰”的美称，顶上珍宝指的就是莲花生，对此《文殊根本续》中言：“三者中比丘为殊胜。”嘉贝扎巴言：“不具足三律仪，难成密咒之主宰。”《密集后续》（藏语）言：“在外行持声闻法，于内极喜密集续。”与上所说相符，莲花生是位修善沙门瑜伽师。一位至吐蕃的匠师造八十大成就师像时，对多杰丹巴拉卡浦巴所作赞颂曰：“以比丘身获成就，降伏西南之罗刹，扎跋哇（藏语）为名号者，对此上师行敬礼。”宁玛派人士将词句改为“向比丘身行敬礼，名班玛噶拉者。”这正如盲人为混骗明眼者而指示道路般，愚不可及。
布玛拉弥扎在赤松德赞时期，稍后于噶玛拉希拉入蕃。据说？皈依六分支？、？般若心经释？、？渐次与顿时法门？的作者到过吐蕃，其非出家人，而着瑜伽师装。继后着比丘装而著作？分别解脱经释？的作者亦入吐蕃。
现今的宁玛派教法的分类，对下士有声闻、独觉、菩萨三乘；对中士有事部、行部、瑜伽部，为密教外三乘，对上士有玛哈、阿尼、阿底内三乘，共为九乘。其中把外三乘和内三乘称为六密续部。属于外密续部的事部，总的有六密续，分别类有三种，零星类有五部弥罗尼等；行部有？毗卢遮那佛密续？等；瑜伽部有金刚界密续等，以上密续亦传于新派中。内三密续中，玛哈部的根本续有“天空大海打的”和“三平等”，及身语意、功德、事业的六密续，计为十万零七十二品，口诀续有《威力炽热》、《如火炽热》、《黑密月等？；阿尼部有《幻变圣士念从》（藏语）、《金刚橛能越》（藏语）、《布谷鸟游戏》（藏语》、《集明》（藏语）、《意集》（藏语）、《文字极净》（藏语），此为“六经”，及《摄集精滴》（藏语）等为根本四密续，身语等的教决密咒，有明咒总的修习嘿若嘎怛特罗，分别类为“黑密月”、莲花语等，修法六部中有《喀采诅咒》（藏语）和食子续等；阿底部中有《心超鸟力无际虚空》（藏语）等，界根本续二十五（藏语）、《理之布谷鸟》（藏语），教决密续教授十八卷，讲说密续有《根除轮回》、《心本续》、《阿底庄严》（藏语）等，总的和分别类的密续量等虚空。
幻变经、集经、心品（生起次第）三部中，集经类有阿尼瑜伽十二、生起阿底瑜伽、玛哈瑜伽经和咱续（藏语），咱续有总续和身、口、意、功德、事业之续各三部，共为怛特罗十八大部。心品类即大圆满法，有心部（母子十八经）、界部（黑白花三种）、口决部（心要）三部，其中口诀心要分讲续、瑜伽续二类，各有外、内、秘密、无上四种。藏区所译心部教授有？理之布谷鸟？等十八卷获二十一卷，大圆满总续二十五，界部方面有？根除轮回？等十万（藏语）颂，口诀方面有《莲花界明》（藏语）等五万一千颂。
如来集经（藏语）有总的和分别之根本续十二，另总的有五大续，特殊十续。
分之类有所谓“八大修法”，其中出世间五部，有文殊身三十四，莲花语十二，真实意十八，甘露功德九，金刚橛事业有不提达玛拉、父续、母续等诸总续。其中金刚橛法分别言之，则布提达玛拉（藏语）有三根本续、十讲说续、十教决续、似叶者三续、似心要者五续、似果实者四续、及武器堆集之续（藏语），共三十六续。橛法类母续有四顶（藏语）、分支回遮十二（藏语）、事业四，及护法十二之续等。橛法父有身等五续（藏语）、心要三、分支“十忿怒”之十续（藏语）、叶四、花十、果四、增补五，有三根本续，另其他分支续甚多。
“八大修法”中，“世间三部”为差遣非人、世间供赞、猛厉诅咒，各有根本续和特殊续二类，其等之身口意续纯净并有数目。但也有不少因混杂而不纯净者，尤其是据说大圆满法与和尚宗相混合。如此引许多数目和起各种名称编排而讲说，且世间三部中混合有西藏本教法等，如供赞世神的坛场中有占布（藏语）等很多西藏本土的神鬼，以此可知混杂有不纯净的成份。
宁玛派密续的讲说者和传承，宁玛派认为远古生死未分为二，佛和众生皆不存，仅有为一体的自然之生死或本体（藏语）或阿赖耶未造作的本性。后从中出现生死二法，初出名普贤者，能自识自性，非行普通道法二觉悟，其法性从原始起，未经错乱而普遍所有动静世间＇11＇，充盈大虚空而化现，并言此普贤者为一切佛的鼻祖。此说若非同一处道教法相混，则为善好，但又与普通传称的显密教法不一致，是甚为稀奇之语。又言从普贤法身中出报身佛四十二位，其威力增出饮血众神五十八尊（藏语），并出许多大悲观世音的化身。言报身金刚萨埵讲说事部、瑜伽部、行部密教外三乘，六种化身（藏语）的六能仁讲说诸法，化为人的能仁释迦狮子讲示声闻、独觉、菩萨三乘。声闻等三乘成佛后的住地分别是法性义之色究竟天（藏语）、影象壮丽庄严天（藏语）、天界色究竟天（藏语）。关于旧密续的出现，《集经》言大圆满法首先在色、无色、欲界三天界传播，后弘传于人间。大圆满法的“二心要”等的传承逐次由噶热多杰、嘉贝谢宁、室僧诃、嘉贝谢宁后者、莲花生、阿雅德哇、桑杰益西等传出，为“佛意传”（藏语）。教诀精汁四类由室僧诃、札那斯扎、无垢友传出，为持明标传（藏语身法嘉贝谢宁传出，口那噶支那，意？钦噶热，功德布玛拉弥扎，事业查哇哈底，非人达那僧诃，猛咒希那达噶坝，供赞仁增若布古雅）。另金刚手传于噶热多杰，噶热多杰传授给桑杰桑哇、斯底、莲花生、格多杰、布玛拉，并由吐蕃君臣逐次相承，此传承为大圆满三受教中的“凡夫耳传”云云。大圆满的心、界、口诀三部中，《心识十八》由贝若杂那、布玛拉、勾玛热、玉扎等翻译为藏文。界部由贝杂那传出。口诀心要精滴类部分由布玛拉和娘·定埃增等人传出。大圆满总传（藏语）大都藏于钦浦，其它教诀传予国王赤松德赞父子、臣民娘·定埃增、噶哇·贝孜、觉日·龙坚赞五人，藏于谐拉康寺。教授阿尼（藏语）由金刚萨埵传秘密主，秘密主传圣种五贤。玛哈瑜伽神变类，由普贤传至神、龙、夜叉、人等，部分由 布玛拉传给玛译师。国王咱续怛陀罗十八部由俄丹菩提、僧诃拉咱、色英郭玛德卫等传出。莲花生和布玛拉等将与真实密续相一致的密法耳传讲授给少许具缘弟子，后因在文字上稍有错乱，杜撰捏造者遂予改窜，并公开传授，但不一定假借了普贤、莲花生、布玛拉等之名而作宣扬。无论怎样，宁玛派教法从贝若杂那、阿杂热玛雅止、古日曲旺、索·益西旺秋、素波·贝益西、娘·定埃增桑波、玛译师仁钦却、努·桑杰益西、乌隆巴或名索尔且·释迦迥乃、甲波巴或称索尔琼·谢热扎巴等人得到弘传，但最主要者是玛和索（藏语）、索尔（藏语）、努三师，似由其等著作大部分教法。
称为伏藏师的向扎西多杰（从乌由和钦浦掘藏）、香萨热巴（从林卓欠邓）、吉关那波（从坚浦之斯木）、尼玛沃色等人据说从三大伏藏处掘出《玛尼全集》等大量的伏藏经典。
继叙说从阿阇梨莲花生受听旧派教授获得解脱而示成就相的诸大师，“王臣心传八弟子，深甚密法合器者，在八法如来摄集坛城中，役使众神七百二十七。授密咒大悲总教之灌顶。给蕃人努·南喀宁布，说真实意续和教诀；对努氏僧桑杰益西，授阎罗密续和修法；向恩兰·嘉哇却央，说莲花语续和修法；向兰钦·贝吉僧格，宣说世间供赞续和修法；给拉色化身觉莫措加，授金刚童子续和修法；给班德卓弥·贝吉益西，说差遣非人续和修法；给译师巴果·贝若杂那，授猛厉咒续和修法；给国王赤松德赞，说大胜功德续和修法、如来摄集一切续五部，及分别续部的内十三，共说一百三十八。南喀宁布能骑太阳光，桑杰益西插橛于崖上，加哇却央三次得马鸣，喀钦措加能起已斩尸，贝益西役使非人为奴，贝吉僧格能驱使天魔，贝若杂那具慧眼，赞普成就世间不动定，玉扎宁波具殊胜悟，占那古玛拉示神变，多杰董军似风无阻碍，益西央飞翔天空中，索波拉白从颈擒猛兽，那囊益西于空似鸟飞，贝吉旺秋得橛成就，丹玛孜芒获不妄陀罗尼，噶哇·贝孜得他心通，续布·贝僧能使水倒流，加哇洛追起尸能变金，齐琼洛能擒虚空鸟，占巴南喀能拽北方之野牛，沃占旺秋入水似游鱼，玛妥·仁钦以岩为粮，贝吉多杰山崖无阻碍，朗卓·官却降雷似射箭，加哇绛曲空中坐跏跌。”上面所言如果并非是对谎言的夸张，则定是十分稀奇的。
关于宁玛派的不共法类，因未见格鲁派其他大喇嘛对此有广闻者，故未得可靠资料。虽如此，但佛王格敦嘉措和索南嘉措对宁玛派的不共法曾少许受听，尤其是一切知者阿旺洛桑嘉措，为全藏区的上师，没有宗派之见，特别对宁玛派比他派更为重视，而详闻其教法。根据洛桑嘉措所作闻法录后三函，其所获灌顶教授分二，第一五智力（藏语）灌顶，传承逐次是法身普贤父母、五种姓佛、圣士白幢（藏语），其变化为释迦能仁、持金刚、金刚萨埵三尊而授给金刚手、多杰曲、秘密主三位。“经函”（藏语）的灌顶由秘密主传恩扎贝提（藏语）。恩扎贝提传阿？梨、桑杰二师。本尊的灌顶传承为金刚萨埵、噶热多杰、室僧诃传邬仗那仁波且（指莲花生—译者）。善巧班智达的灌顶，由普贤的化身色莫郭玛德卫传布玛拉，布玛拉传邬仗那仁波且。明学和技艺的灌顶，邬仗那仁波且自然而得。以上为六大灌顶水。分别修法八部（藏语）各个的灌顶，邬仗那活佛（藏语）从八大持明师（藏语）处获得。第二密续部教授（藏语）的传承，五种姓佛传多杰曲，多杰曲讲说给圣种五贤＇12＇，从圣种五贤起，怛特罗十八部及尤其“总别十五” （藏语）集为文字，而分义传承和语传承。义传承由恩扎贝提（藏语）等六人以“信号相传”（藏语）。语传承交付给空行母勒吉旺莫钦，但后来其因未得合器弟子，遂装在铁铜等八箱中，伏藏于坟地寒林，后由八持明者和邬仗那钦波掘出，称“成就师瑜伽传”，由经教、伏藏二规。其中经教努萨宗（藏语）的灌顶传承来自四善巧，即班智达希那达噶坝、若布古雅德哇真扎、达那散支答、莲花生，之后传仓巴拉梅朵、努·南喀宁布、努·桑杰益西、努·永丹嘉措、前努·益西嘉措、却格宁波、甲盖多杰、绰波拜哇、达玛坚赞、？钦·扎西达、钦波绛贝、达玛僧格、岗尊拉杰、努·益西嘉措、热本却·贝桑波、日哇·尊珠贡、索南公保、曲吉僧格、嘉央仁加、其子班玛旺加、勒丹多杰、止贡·仁钦彭措、那色·扎西嘉措、贡噶且却、阿旺益西珠巴、后索尔钦·曲央让卓，从曲央让卓处由八修部的大持明者出家法名阿旺洛桑嘉措，密号为喇梅多杰孜、岗显让卓、斯诺扎孜多杰查同者受听。
经教（藏语）年宗（藏语），从邬那大师、布玛拉、努·南喀宁布、大译师贝若杂那四人处由年·却热宣尼爱听，至年热间依次相承。经教聂宗（藏语），有邬仗那大师传聂支那勾玛热，之后由努·桑杰益西等人相传。
伏藏宗（藏语），由邬仗那大师传于王臣九人等。其有火神（藏语）、本尊神加持、经教摄受空行受命、金刚虚空瑜伽等所传四种，据说从年热以下，经教、伏藏二宗合流。
以上所有之灌顶传承一直传到第五世达赖阿旺洛桑嘉措等人之间。
大圆满心要类及“经”（藏语）等的灌顶教授教诀的传承，亦有索、索尔、努三宗规的各自传承，逐次各有近传、远传、分传。以索尔宗为例，其传承为法身无量光佛、报身佛圆满大乐、化身莲花妥昌、益西措加、那囊·多杰董圈、伏藏师勒丹多杰、策仁旺波、后索尔钦·阿旺彭措，从索尔·曲央让卓和伏藏师班玛朗巴处由阿旺洛桑嘉措受听。
“神变类”传承，从桑杰益西处由云丹嘉措钦哇和索·益西旺波二人受听，此二人起逐次传娘·益西迥乃、索尔钦·释迦迥、索尔琼·谢热扎巴、觉·释迦叶、卓浦巴、甲那波、吉师永丹斯、修波东孜、达敦卫巴觉索。
“金刚桥”传承，依次为贝若杂那、邦·弥盼贡保、恩兰·绛曲坚赞、森玛·仁钦尤、雅隆哇·克居贝却、娘·绛扎、娘·谢热迥乃、巴关·益西旺布、郑·达玛菩提、郑琼·觉色柳巴、贡森等。
大圆满心要（藏语）传承，由布玛拉和娘·定�